W celu poznania właściwości biochemicznych białek SSB pochodzących z Deinococcus grandis (DgrSSB) i Deinococcus proteolyticus (DprSSB) sklonowano zaamplifikowane w reakcji PCR geny ssb w systemie ekspresyjnym Escherichia coli. Geny składają się z 891(DgrSSB) i 876 (DprSSB) nukleotydów kodujących odpowiednio 296 i 291 reszt aminokwasowych o teoretycznie wyznaczonej masie cząsteczkowej dla białek, równej 32,29 i 31,33 kDa. Sekwencja aminokwasowa DgrSSB wykazuje odpowiednio 45%, 44% i 82% identyczności a DprSSB - 43%, 43%i 69% identyczności z białkami SSB pochodzącymi z Thermus aquaticus (TaqSSB), Thermus thermophilus (TthSSB) and Deinococcus radiodurans. Wykazano, że DgrSSB i DprSSB są podobne do białek SSB z Thermus/Deinococcus w ich właściwościach biochemicznych. Funkcjonują jako homodimery z monomerem charakteryzującym się dwiema domenami OB wiążącymi jednoniciowe DNA. W eksperymencie wygaszania naturalnej fluorescencji tryptofanów z poly(dT), oba białka wiążą ssDNA o długości ok. 33 nt na homodimer. DgrSSB i DprSSB wykazują zdolność komplemetacji funkcji EcoSSB w warunkach in vivo. Termostabilność z okresem półtrwania wynoszącym 1 min w 65-67,5°C czyni DgrSSB i DprSSB podobnymi do znanego białka SSB pochodzącego z Deinococcus radiodurans (DraSSB).
Authors
Additional information
- Category
- Publikacja w czasopiśmie
- Type
- artykuł w czasopiśmie z listy filadelfijskiej
- Language
- angielski
- Publication year
- 2007
