W ostatnich latach znacznie wzrosło zainteresowanie organizmami zimnolubnymi, głównie z powodu ich enzymów o biotechnologicznym znaczeniu. Jednak, aby wydajnie produkować takie enzymy w skali przemysłowej użyteczne jest stworzenie rekombinantowych systemów ekspresyjnych, które pozwolą na ich opłacalną produkcję. W osiągnięciu tego celu mogą pomóc odpowiednie wektory, konstruowane na bazie plazmidów pozyskiwanych z bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych. Celem niniejszej pracy jest zatem poszukiwanie odpowiedniego plazmidu kryptycznego, który posłuży do konstrukcji wektora wahadłowego. Poznano sekwencję nukleotydową DNA plazmidu kryptycznego, nazwanego pKW1, izolowanego ze szczepu zimnolubnej bakterii Pseudoalteromonas sp. 643A. Analiza sekwencji nukleotydowej wykazała obecność trzech otwartych ramek odczytu kodujących białka posiadające wysoki stopień identyczności, odpowiednio z białkiem Rep z Psychrobacter cryohalolentis K5 (87%), białkiem MobA z Hafnia alvei (46%) oraz hipotetycznym białkiem z Psychrobacter cryohalolentis K5 (65%) i Psychrobacter arcticus (65%). Wyznaczono również potencjalne miejsca promotorowe transkrypcji, przypuszczalne miejsce wiązania rybosomu oraz sekwencje repetytywne w obrębie genu kodującego białko replikacyjne. Obecność zakonserwowanych motywów tuż za genem rep, wykazujących znaczny stopień homologii z sekwencjami wiązanymi przez białka Rep w plazmidach typu ColE2, może sugerować, iż analizowany plazmid pKW1 replikuje się według modelu theta.
Authors
Additional information
- DOI
- Digital Object Identifier link open in new tab 10.1016/j.plasmid.2008.06.002
- Category
- Publikacja w czasopiśmie
- Type
- artykuł w czasopiśmie z listy filadelfijskiej
- Language
- angielski
- Publication year
- 2008
