Podstawowymi modelami historii ewolucji organizmów są drzewa i sieci filogenetyczne. Ponieważ algorytmy konstrukcji filogenów zwracają różne wyniki dla tych samych danych wejściowych, powstaje problem oceny, który filogen najlepiej reprezentuje historię ewolucji dla zadanego zbioru gatunków. W pracy podano definicję metryki dla przestrzeni drzew o n liściach, zwanej metryką błędu. Dokonano przeglądu miar odległości na przestrzeni sieci filogenetycznych, bazujących na metryce wprowadzonej dla drzew, wraz z analizą modelu, dla którego miary te spełniają nierówność trójkąta. Z wykorzystaniem programu phylonet przeprowadzono porównanie przykładowych topologii zarówno drzew, jak i sieci, oraz dokonano oceny, na ile wprowadzone miary odzwierciedlają rzeczywistość
Authors
Additional information
- Category
- Publikacja w czasopiśmie
- Type
- artykuły w czasopismach recenzowanych i innych wydawnictwach ciągłych
- Language
- polski
- Publication year
- 2007