Publications Repository - Gdańsk University of Technology

Page settings

polski
Publications Repository
Gdańsk University of Technology

Treść strony

Porównywanie topologii drzew i sieci filogenetycznych z wykorzystaniem metryki błędu

Podstawowymi modelami historii ewolucji organizmów są drzewa i sieci filogenetyczne. Ponieważ algorytmy konstrukcji filogenów zwracają różne wyniki dla tych samych danych wejściowych, powstaje problem oceny, który filogen najlepiej reprezentuje historię ewolucji dla zadanego zbioru gatunków. W pracy podano definicję metryki dla przestrzeni drzew o n liściach, zwanej metryką błędu. Dokonano przeglądu miar odległości na przestrzeni sieci filogenetycznych, bazujących na metryce wprowadzonej dla drzew, wraz z analizą modelu, dla którego miary te spełniają nierówność trójkąta. Z wykorzystaniem programu phylonet przeprowadzono porównanie przykładowych topologii zarówno drzew, jak i sieci, oraz dokonano oceny, na ile wprowadzone miary odzwierciedlają rzeczywistość

Authors

Additional information

Category
Publikacja w czasopiśmie
Type
artykuły w czasopismach recenzowanych i innych wydawnictwach ciągłych
Language
polski
Publication year
2007

Source: MOSTWiedzy.pl - publication "Porównywanie topologii drzew i sieci filogenetycznych z wykorzystaniem metryki błędu" link open in new tab

Portal MOST Wiedzy link open in new tab