Publications Repository - Gdańsk University of Technology

Page settings

polski
Publications Repository
Gdańsk University of Technology

Treść strony

Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital

Zakażenia układu moczowego (UTIs - ang. urinary track infections) są jedną z najczęstszy infekcji, za które w 85% przypadków odpowiedzialne są bakterie Escherichia coli. Infekcje układu moczowego mogą prowadzić do groźnych powikłań m. in. odmiedniczkowego zapalenia nerek. Śmiertelność wśród tej grupy pacjentów wynosi 1-3%. Zakażenia układu moczowego występują również u ok. 7% kobiet ciężarnych. W pracy przebadano 82 szczepy E. coli pobranych z materiału klinicznego pacjentów Akademii Medycznej w Gdańsku w latach 2006-2009. W przeprowadzonych badaniach wykrywano obecność siedmiu czynników wirulencji charakterystycznych dla uropatogennych szczepów E. coli ,takich jak adhezyny czy cytotoksyny z wykorzystaniem klasycznej techniki PCR oraz techniki złożonego PCR (tzw. multipleks PCR).W multipleksowej reakcji PCR wykrywano obecność: fimbrii typu P, fimbrii typu S, cytotoksycznego czynnika nekrotyzującego CNF1, bakteriocyny Usp charakterystycznej tylko dla szczepów uropatogennych, fimbrii typu I oraz alfa hemolizyny. W oddzielnej reakcji PCR wykrywano obecność adhezyn z rodziny Dr. Celem badań było badanie transmisji uropatogennych szczepów E. coli z układu moczowego do układu krwionośnego. Do badania pokrewieństwa genetycznego wykorzystano referencyjną technikę REA-PFGE (ang. Restriction Enzyme Analysis - Pulsed Field Gel Electrophoresis) uznawaną za "złoty standard" w genotypowaniu oraz alternatywną technikę PCR MP (ang. Melting Profiles). Technika REA-PFGE jest analizą restrykcyjną połączoną z elektroforezą pulsacyjną, natomiast technika PCR MP oparta jest na amplifikacji PCR poprzedzonej ligacją adaptorów oligonukleotydowych do fragmentów restrykcyjnych genomowego DNA. Na podstawie uzyskanych wyników stwierdzono, że w większości przypadków izolaty pochodzące z krwi i z moczu były identyczne pod względem genetycznym.Uzyskane wyniki były porównywane z użyciem techniki REA-PFGE. Przedstawiona analiza sugeruje, że prawdopodobną przyczyną wystąpienia urosepsy w badanych przypadkach może być zakażenie układu moczowego.

Authors

Additional information

Category
Aktywność konferencyjna
Type
publikacja w wydawnictwie zbiorowym recenzowanym (także w materiałach konferencyjnych)
Language
polski
Publication year
2009

Source: MOSTWiedzy.pl - publication "Genotyping and characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from patients from Polish hospital" link open in new tab

Portal MOST Wiedzy link open in new tab