Opracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali w Polsce. Nasze wyniki wykazały, że metoda ITS-PCR jest przydatna do badania filogenetycznych relacji szczepów K. oxytoca , natomiast PCR MP ze względu na wysoki potencjał różnicujący jest użytecznym narzędziem w badaniach epidemiologicznych K. oxytoca. W niniejszej pracy przydatność metody PCR MP testowano na dwóch zestawach szczepów wyizolowanych z jednej jednostki w krótkim okresie czasu. Wyniki wykazały, że metoda PCR MP ma wysoką moc dyskryminującą i może być przydatna do badań epidemiologicznych blisko spokrewnionych szczepów K. oxytoca izolowanych z pojedynczej jednostki w krótkim okresie czasu w celu identyfikacji źródła i dróg rozprzestrzeniania się zakażenia. Zaletą metody PCR MP jest możliwość zastosowania gradientu temperatury denaturacji podczas PCR w celu potwierdzenia wyników genotypowania. Ze względu na te właściwości i wysoką moc dyskryminującą metody PCR MP, co pokazano w pracy dla określenia genetycznego podobieństwa szczepów K. oxytoca, zaproponowano metodę PCR MP jako jedną z najlepszych technik do analizy krótko terminowych epidemii.
Authors
- Karolina Stojowska link open in new tab ,
- Stanisław Kałużewski,
- dr hab. Beata Krawczyk link open in new tab
Additional information
- Category
- Publikacja w czasopiśmie
- Type
- artykuł w czasopiśmie indeksowanym TR Master Journal List
- Language
- angielski
- Publication year
- 2009
