Analiza genetyki populacji i określenie powiązań filogenetycznych pomiędzy szczepami może być niezwykle użytecznym podejściem w określaniu rozprzestrzeniania się wzorów genetycznych różnych gatunków bakterii na potrzeby epidemiologiczne. Nie ma danych, które opisywałyby długoterminowe sytuacje epidemiologiczne powodowane przez wielolekooporne, oportunistyczne szczepy Klebsiella oxytoca metodami molekularnymi. Celem przedstawionych badań była ocena różnorodności genetycznej szczepów K. oxytoca izolowanych przez ponad 50 lat z wykorzystaniem metod genetycznych ITS-PCR i PCR MP dla dużej kolekcji szczepów pozyskiwanych od pacjentów z kilku szpitali w Polsce. Analiza filogenetyczna oparta na ITS-PCR wyodrębniła sześć odrębnych grup. Zidentyfikowano dwie główne grupy Kox i KoY, odpowiednio z czterema i dwiema podgrupami wewnątrz Kox i KoY. Typowanie z zastosowaniem metody PCR MP wykazało wyższy poziom różnorodności genetycznej. Jednak wszystkie szczepy K. oxytoca były również podzielone na sześć grup genotypowych (KoA, KoB, KoC, koD, KoE i KoF). Podsumowując, możemy stwierdzić, że metody genotypowania ITS-PCR i PCR MP są przydatne w określeniu filogenetycznych relacji genetycznych K. oxytoca.
Authors
Additional information
- Category
- Publikacja w czasopiśmie
- Type
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Language
- angielski
- Publication year
- 2009
