Publications Repository - Gdańsk University of Technology

Metryki filogenetyczne umożliwiają ocenę jakości wyników analizy filogenetycznej oraz wiarygodności algorytmów przeprowadzających taką analizę. Aplikacja TreeCmp oferuje efektywne, wielomianowe implementacje ośmiu takich metryk (dla drzew nieukorzenionych i zawierających korzeń) zdefiniowanych dla dowolnych filogenez (nie koniecznie binarnych). Program ten jako pierwszy umożliwia wyznaczanie nowych metryk, definiowanych w oparciu o najlżejsze skojarzenie w grafie dwudzielnym. Zaprezentowano też przykład zastosowania omawianego oprogramowania do oceny nowego algorytmu rekonstrukcji drzew filogenetycznych.

Authors

• Damian Bogdanowicz link open in new tab ,
• prof. dr hab. inż. Krzysztof Giaro link open in new tab ,
• Borys Wróbel link open in new tab