W celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu na chromosomie. Produkty amplifikacji PCR poddawano analizie restrykcyjnej (metoda DR-PCR/RFLP). Przebadano 90 szczepów Acinetobacter baumannii, izolowanych od pacjentów Szpitala Klinicznego w Bydgoszczy. Wszystkie szczepy były najpierw typowane z użyciem techniki REA/ApaI/-PFGE. Uzyskano 21 unikalnych typów. Metoda DR-PCR/RFLP wykazała niższą siłą dyskryminacji niż REA-PFGE, wyróżniono 12 klasterów, jednakże może być alternatywną techniką w badaniach epidemiologicznych w szukaniu wewnątrzgatunkowych relacji szczepów A. baumannii.
Autorzy
- Alicja Nowak-Zaleska,
- dr hab. Beata Krawczyk link otwiera się w nowej karcie ,
- dr hab. inż. Roman Kotłowski link otwiera się w nowej karcie ,
- Agnieszka Mikucka,
- Eugenia Gospodarek
Informacje dodatkowe
- Kategoria
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ
- artykuł w czasopiśmie z listy filadelfijskiej
- Język
- polski
- Rok wydania
- 2008
