Sprawdzono zdolność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) do przewidywania wartości pKa w roztworze wodnym dla O-fosfoseryny (P-Ser). Obliczenia przeprowadzono w ramach teorii funkcjonału gęstości (DFT) przy użyciu funkcjonałów B3LYP i M06-2X oraz baz 6-31+G(d) and 6-31+G(d,p). Obliczenia na poziomie B3LYP/6-31+G(d,p) przy użyciu modelu solwatacji SMD zapewniają doskonałą zgodność z doświadczeniem, pod warunkiem uwzględnienia w sposób jawny co najmniej 4 cząsteczek wody hydratacyjnej. Konwersja neutralnej P-Ser w roztworze wodnym w formę jonu obojnaczego jest procesem niezwykle szybkim. Energie swobodne aktywacji obliczone w podobny sposób jak pKa są bardzo niskie a wartość energii swobodnej reakcji sugeruje całkowite zajście przemiany P-Ser w formę obojnaczą.
Autorzy
Informacje dodatkowe
- DOI
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego link otwiera się w nowej karcie 10.1016/j.cplett.2010.10.063
- Kategoria
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Język
- angielski
- Rok wydania
- 2010
Źródło danych: MOSTWiedzy.pl - publikacja "Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution" link otwiera się w nowej karcie
