Publications Repository - Gdańsk University of Technology

Page settings

polski
Publications Repository
Gdańsk University of Technology

Publications from the year 2011

Show all
  • Distributed Representations Based on Geometric Algebra: the Continuous Model
    • Agnieszka Patyk-Łońska
    • Marek Czachor
    • Diederik Aerts
    2011 Full text Informatica

    Authors revise the concept of a distributed representation of data as well as two previously developed models: Holographic Reduced Representation (HRR) and Binary Spatter Codes (BSC). A Geometric Analogue (GAc - ''c'' stands for continuous as opposed to its discrete version) of HRR is introduced - it employs role-filler binding based on geometric products. Atomic objects are real-valued vectors in n-dimensional Euclidean space while complex data structures belong to a hierarchy of multivectors. The paper reports on a test aimed at comparison of GAc with HRR and BSC. The test is analogous to the one proposed by Tony Plate in the mid 90s. We repeat Plate's test on GAc and compare the results with the original HRR and BSC-we concentrate on comparison of recognition percentage for the three models for comparable data size, rather than on the time taken to achieve high percentage. Results show that the best models for storing and recognizing multiple similar structures are GAc and BSC with recognition percentage highly above 90. The paper ends with remarks on perspective applications of geometric algebra to quantum algorithms.


  • Distributed Trust Management Model for Wireless Sensor Networks
    • Janusz Górski
    • Alan Turower
    • Andrzej Wardziński
    2011 Full text


  • Distribution and removal efficiency of heavy metals in two constructed wetlands treating landfill leachate
    • Ewa Wojciechowska
    • Sylvia Waara
    2011 WATER SCIENCE AND TECHNOLOGY

    The results of heavy metals (Fe, Mn, Zn, Ni, Cu, Cr, Pb, Cd) removal and partitioning between aqueous and solid phases at two wetlands (TWs) treating municipal landfill leachates are presented. One of the TWs is a surface flow facility consisting of 10 ponds. The other TW is a newly constructed pilot-scale facility consisting of three beds with alternately vertical and horizontal sub-surface flow. The metals concentrations were analysed in leachate (both TWs) and bottom sediments (surface flow TW). Very high (90.9 - 99.9%) removal rates of metals were observed in a mature surface flow TW. The effectiveness of metals removal in a newly constructed pilot-scale sub-surface flow wetland were considerably lower (range 0 to 73%). This is attributed to young age of the TW, different hydraulic conditions (sub-surface flow system with much shorter retention time, unoxic conditions,) and presence of metallic complexes with refractory organic matter.


  • DNA methylation in cancer development, diagnosis and therapy-multiple opportunities for genotoxic agents to act as methylome disruptors or remediators
    • Joanna Lewandowska
    • Agnieszka Bartoszek-Pączkowska
    2011 Full text MUTAGENESIS

    The role of DNA methylation and recently discovered hydroxymethylation in the function of the human epigenome is currently one of the hottest topics in the life sciences. Progress in this field of research has been further accelerated by the discovery that alterations in the methylome are not only associated with key functions of cells and organisms, such as development, differentiation and gene expression, but may underlie a number of human diseases, including cancer. This review describes both well established and more recent observations concerning alterations in the methylome, i.e. the global and local distribution of 5-methylcytosines, involved in its normal functions. Then, the changes in DNA methylation pattern seen in cancer cells are discussed in the context of their utilisation in cancer diagnostics and treatment. On this basis, comparisons are made between natural covalent DNA modification and that induced by genotoxic agents, chemical carcinogens and antitumour drugs as regards their impact on epigenetic mechanisms. The available data suggest that DNA damage by genotoxins can mimic epigenetic markers and in consequence disrupt the proper function of the epigenome. On the other hand, the same processes in cancer cells, e.g. DNA demethylation as a result of DNA methyltransferase blocking or the induction of DNA repair by DNA adducts, may restore the activity of hypermethylated anticancer genes. The observed multiple mechanisms by which genotoxic agents directly affect methylome function suggest that chemical carcinogens act primarily as epigenome disruptors, whereas mutations are secondary events that occur at later stages of cancer development when genomeprotecting mechanisms have already been deregulated.


  • DNA restriction analysis as a supportive tool in mechanistic studies carried out by 32P-postlabelling
    • Dominik Kołodziejski
    • Tadeusz Pilipczuk
    • Barbara Fedejko - Kap
    • Anita Dopierała
    • Agnieszka Bartoszek-Pączkowska
    2011 MUTAGENESIS

    Numerous antitumor and carcinogenic compounds are able to modify DNA by forming covalent bonds with its constituents, while some anticarcinogenic compounds are known to prevent such a modification. All these processes are of vital biological import_ance, though deeper inside into factors influencing formation of DNA adducts is difficult due to the low level of their occurrence. 32P-Postlabelling approach ensures very sensitive detection of DNA binding induced by a variety of genotoxins, however, the employment of this technique to mechanistic studies is too expensive, time consuming and sort of restricted by the risk associated with the exposure to radiochemicals to become widely applied. In our research, we were trying to workout a simple approach that would enable optimisation of conditions of DNA binding or its prevention in cell-free system as a preliminary step before 32P-postlabeling experiments. As a result, the DNA restriction analysis method to detect DNA covalent modification has been developed. This method uses a DNA amplicon that is 695 bp long and contains two restriction sites: one consisting of only GC base pairs recognized by restriction endonuclease MspI or HpaII, methyl-insensitive and methyl sensitive, respectively, and the other consisting of only AT base pairs recognized by the enzyme Tru1I. The covalent modification of the restriction sites abolishes their recognition and thus cleavage by the restriction enzymes. By incubating the DNA amplicon with increasing concentrations of the studied compound(s) in the appropriate activating system, the formation of DNA adducts is induced. Then, the modified amplicon is submitted to digestion by the mentioned endonucleaues and the DNA fragments are separated by polyacrylamide gel electrophoresis. The inhibition of cleavage indicates the occurrence of covalent modification of the restriction site(s) simultaneously pointing at the kind of base pairs involved in DNA adduct formation. The examples will be given demonstrating the application of the described technique to detect DNA modifications, including oxidation of nucleobases, by a number of genotoxic agents. Also, the follow up of kinetics of such reactions and identification of metabolic stages of activation involved in formation of DNA reactive species will be illustrated.


  • DNA-reactive anticancer imidazoacridinone C-1311 is a new inhibitor of hypoxia-inducible factor 1 alpha, vascular endothelial growth factor and tumor angiogenesis
    • Anna Skwarska
    • Jolanta Paradziej-Łukowicz
    • Grażyna Peszyńska-Sularz
    • Anna Brillowska-Dąbrowska
    • Jerzy Konopa
    2011 ANNALS OF ONCOLOGY

    Hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1) plays a critical role for tumor adaptation to hypoxia and promotes angiogenesis. Antitumor imidazoacridinone C-1311 is a DNA reactive topoisomerase II and FLT3 receptor tyrosine kinase inhibitor selected for phase II clinical trials for breast cancer. Here, we demonstrate the new mechanism of C-1311 action involving HIF-1a, vascular endothelial growth factor (VEGF) and angiogenesis as additional targets. In a cell-free system, C-1311 prevented HIF-1a binding to oligonucleotide encompassing a canonical hypoxia-responsive element (HRE), but did not disrupt the formation of protein-DNA complex through direct interference with HIF-1a. In human colon cancer HCT116 cells, C-1311 was found to down-regulate HIF-1a mRNA and protein level, which prevented hypoxic activation of VEGF gene, resulting in decreased VEGF protein expression. Importantly, C-1311 blocked hypoxia-induced VEGF protein production irrespective of the p53 tumor suppressor status (wt versus lack of p53). To a lesser extent, C-1311 also reduced basal VEGF mRNA and protein level under normoxia. In murine melanoma B16/F10 cells,C-1311 only slightly inhibited HIF-1a mRNA accumulation but vitally decreased VEGF mRNA and protein expression. Consistent with HIF-1a and VEGF inhibition/depletion observed in vitro, C-1311 significantly affected angiogenesis in vivo. C-1311 at a single dose (40 mg/kg), inhibited bFGF stimulated angiogenesis by 70%, in terms of vascularization of Matrigel plugs in mice. Compared with single administration, continuous low C-1311 dosing (8 mg/kg/day for 5 days), gave more profound angiogenesis inhibition (80%), suggesting that this effect is schedule-dependent. Antiangiogenic activity of C-1311 was further confirmed in experiments, where angiogenesis was stimulated by murine melanoma B16/F10 cells encapsulated in alginate beads and implanted into mice. C-1311 at 8 mg/kg, when given for 9 days, completely abrogated vascularization of alginate implants. Even at lower doses of 4-6 mg/kg, C-1311 decreased implants' angiogenesis by 40-60%, respectively, indicating that its inhibitory action on tumor angiogenesis is dose-dependent. In summary, this study provides the first evidence, that antitumor effect of C-1311 involve both interference with HIF-1a/HRE transactivating activity and downregulation of HIF-1a mRNA and protein accumulation, resulting in decreased hypoxia-induced VEGF expression. Importantly, C-1311-driven VEGF depletion leads to a significant reduction of in vivo angiogenesis.


  • Dobór elementów instalacji fotowoltaicznych - instalacje off-grid
    • Ewa Klugmann-Radziemska
    2011

    W artykule przedstawiono podstawy projektowania instalacji samodzielnych fotowoltaicznych. Początkowa - bardzo ważna - faza projektowania instalacji fotowoltaicznej to opracowanie koncepcji i przygotowanie założeń projektowych. Wybór niewłaściwego rozwiązania może doprowadzić do znacznego wzrostu kosztów, a nawet nieopłacalności przedsięwzięcia.Chociaż systemy fotowoltaiczne mogą sprowadzać się do tak prostego rozwiązania jak: moduł i obciążenie (np. w postaci pompy wodnej lub wiatraczka), to najczęściej muszą one zasilać w energię urządzenia pracujące nie tylko wtedy, gdy są w stanie ją wytworzyć. Dlatego system musi być wyposażony w układ do akumulowania wyprodukowanej energii (baterię akumulatorów) lub korzystać z podłączenia do sieci elektroenergetycznej (wówczas sieć spełnia rolę akumulatora: moduły oddają nadwyżki energii lub system czerpie energię z sieci, gdy sam produkuje jej zbyt mało).


  • Dobór elementów instalacji fotowoltaicznych - instalacje on-grid
    • Ewa Klugmann-Radziemska
    2011

    Obecnie instalacje fotowoltaiczne dołączone do sieci stanowią 72% wszystkich systemów fotowoltaicznych.System PV podłączony do sieci elektroenergetycznej wytwarza energię, która jest w sposób ciągły przekazywana do sieci, co (przeciwnie niż w instalacjach off-grid) pozwala na całkowite niedopasowanie liczby zamontowanych w instalacji modułów fotowoltaicznych do zapotrzebowania obiektu na energię elektryczną. W efekcie instalacja fotowoltaiczna może pełnić różne funkcje: wytwarzać energię wyłącznie na sprzedaż, wytwarzać energię w ilości pokrywającej własne potrzeby obiektu, z pewną nadwyżką lub pewnym niedoborem. W artykule przedstawiono zasady projektowania instalacji fotowoltaicznych współpracujących z siecią elektroenergetyczną.


  • Dobór parametrów pomiaru cyfrowego profili i jego następstwa w analizie amplitudowo-częstotliwościowej nierówności powierzchni
    • Adam Boryczko
    2011 Full text Mechanik

    Analiza pomiaru cyfrowych nierówności profili jest złożonym problemem interdyscyplinarnym, którego parametry powinny uwzględniać ich charakter i cele postawione dla badanych nierówności powierzchni. Normatywne wysokościowe ujęcia nierówności oraz długościowe, punktowe i inne parametry nie oddają jednoznacznie cech powierzchni, dlatego też poznawcze i badawcze analizy profili powinny być prowadzone funkcjami amplitudowo-częstotliwościowymi ich nierówności. Widma profili uwzględniają rozkład amplitud w częstotliwościowym ujęciu składowych powierzchni i zależą od przyjęcia parametrów pomiaru cyfrowego nierówności. Dlatego też należy liczyć się z konsekwencjami pasmowych ujęć widmowych w zależności od przyjmowanych wartości parametrów pomiarowych, a jednocześnie dopasowanych do charakterów częstotliwościowych analizowanych powierzchni.


  • Dobór sygnałów w cichym sonarze z filtracją dopasowaną
    • Roman Salamon
    • Jacek Marszal
    • Lech Kilian
    • Andrzej Jedel
    • Aleksandra Raganowicz
    • Zawisza Ostrowski
    2011

    Skrytość działania jest pożądaną cechą sonarów w niektórych zastosowaniach militarnych. Można ją uzyskać poprzez emisję sygnałów szerokopasmowych o małej mocy i długim cyklu powtarzania. Głównym problemem w takich cichych sonarach jest negatywny wpływ efektu Dopplera na warunki detekcji i dokładność określania odległości wykrytych celów. W referacie dokonano porównania pod tym kątem trzech rodzajów sygnałów sondujących, a mianowicie sygnałów z liniową i hiperboliczną modulacją częstotliwości i liniową modulacją okresu. Przedstawione wyniki symulacji numerycznych wykazały, że sygnały z hiperboliczną modulacją częstotliwości są najmniej wrażliwe na efekt Dopplera z punktu widzenia warunków detekcji. Dla wszystkich porównywanych sygnałów błędy określania odległości celu są praktycznie jednakowe.


  • Docieranie porowatej powłoki ceramicznej z analizą wpływu wybranych parametrów obróbkowych
    • Piotr Waszczur
    • Adam Barylski
    2011

    W pracy zamieszczono wyniki badań procesu docierania powłoki ceramicznej stosowanej miedzy innymi na współpracujące powierzchnie łożysk ślizgowych. Wyniki zawierają analizę wpływu parametrów obróbkowych takich jak: prędkość docierania v, nacisk jednostkowy p i czas docierania t, na chropowatość powierzchni i ubytek liniowy docieranej powłoki ceramicznej z trójtlenku chromu. Badania realizowano w celu wyznaczenia granicznej wartości parametru chropowatości Ra możliwej do uzyskania w technologicznym docieraniu z wykorzystaniem jednotarczowej docierarki z docierakiem żeliwnym przy zastosowaniu past diamentowych. Istotnym na uzyskane efekty obróbki okazała się porowatość powłoki Cr2O3, która w znacznym zakresie nie pozwala na uzyskanie niskich wartości chropowatości.


  • Dodatki do żywności wspomagające separację pianową białek serwatkowych
    • Bożenna Kawalec-Pietrenko
    • Iwona Hołowacz
    • Karolina Kucharska
    2011 Full text Inżynieria i Aparatura Chemiczna

    Zbadano możliwości poprawy efektywności współprądowej separacji pianowej białek serwatkowych poprzez wzbogacenie surówki o substancje dodatkowe. Aby wyizolowane białko mogło być powtórnie wykorzystane, jako addytywy wybrano substancje powszechnie stosowane w przemyśle spożywczym jako dodatki do żywności: gumę arabską (E 414), gumę ksantanową (E 415) oraz karagen (E 407). Najlepsze efekty tj. najwyższe wartości współczynnika wzbogacenia i stopnia wyflotowania osiągnięto w obecności karagenu w roztworze białka serwatkowego.


  • Dokładne i oszczędne przecinanie drewna piłami tarczowymi. - R. Wasielewski.
    • Roman Wasielewski
    2011

    W pracy przedstawiono podstawy dokładnego i oszczędnego przecinania drewna piłami tarczowymi. Szczególną uwagę zwrócono na zjawiska i zależności zachodzące w rzeczywistym układzie przecinania. Przedstawione w pracy wyniki własnych badań teoretycznych, doświadczalnych, a przede wszystkim badań przemysłowych, pogłębiają wiedzę w zakresie procesów przecinania, a także dają praktyczne wskazówki i zależności matematyczne, stanowiące podstawy dokładnego i oszczędnego przecinania drewna piłami tarczowymi.


  • Dokładność obliczania naprężeń, deformacji, częstości drgań i kąta odwinięcia pióra łopatki wolnonośnej w zależności od dyskretyzacji CSD
    • Paweł Ziółkowski
    2011

    Celem niniejszej pracy jest analiza wpływu dyskretyzacji na dokładność obliczania pióra łopatki wolnonośnej wirnikowej. Zostaną przeanalizowane 4 przypadki dyskretyzacji o różnym zagęszczeniu zarówno w przekroju jak i po długości pióra łopatki. Obliczenia dynamiczne będą zawierały częstości i cztery pierwsze postacie drgań własnych, na których podstawie będzie wykreślony wykres rezonansowy. Z kolei obliczenia wytrzymałościowe kinetostatyczne przedstawią naprężenia i nową geometrię powstałą w wyniku rozkręcenia łopatki.


  • Dominika Krechowicz - Alias znaków, Toruń Galeria Sztuki Wozownia, październik-listopad 2011
    • Dominika Krechowicz
    2011

    Katalog wystawy malarstwa, która miała miejsce w październiku 2011 roku w Galerii Sztuki Wozownia w Toruniu. Katalog liczy 8 stron i zawiera tekst krytyczny w języku polskim i angielskim, notę biograficzną po polsku oraz 10 kolorowych reprodukcji prac. Wydawcą katalogu jest Galeria Sztuki Wozownia z Torunia. ISBN 83-89657-97-x.


  • Doppler effect in the CW FM sonar
    • Jacek Marszal
    • Roman Salamon
    • Krzysztof Zachariasz
    • Aleksander Schmidt
    2011 Full text HYDROACOUSTICS

    When sonars are used for military purposes they have to ensure unobtrusive operation, a feature that can be potentially secured by 'silent sonar' or continuous wave frequency modulation sonars (CW FM sonars). The article presents how these sonars operate and identifies the relations between their parameters. The Doppler effect and its impact on the CW FM sonar are studied to identify how it affects the sonar's parameters. The results of simplified theoretical calculations are supported with results of computer simulations of a more realistic model.


  • Doradztwo dla strategii rozwoju innowacyjnego w MSP
    • Jerzy Koszałka
    • Raf Hubert Jozef Sluismans
    2011

    Omówiono procesy rozwoju innowacji w MSP na współczesnym rynku. Scharakteryzowano doradztwo jako instrument wsparcia innowacyjnego rozwoju MSP w rozwiniętych krajach UE. Zaprezentowano proces doradztwa podstawowego dla strategii innowacyjnego rozwoju w MSP w Polsce. Przedstawiono doradztwo zaawansowane dla strategii innowacyjnego rozwoju w MSP w Polsce.


  • Doskonalenie jakości w kreowaniu sukcesu usług turystycznych
    • Ludmiła Zawadzka
    • Grzegorz Zieliński
    2011 PRACE I MATERIAŁY WYDZIAŁU ZARZĄDZANIA UNIWERSYTETU GDAŃSKIEGO

    W publikacji zaprezentowano zmieniające się podejście klientów do usług turystycznych. Autorzy zaprezentowali obszary składowe usługi turystycznej wraz ze zidentyfikowanym poziomem ich ważności dla klientów. Na podstawie badań własnych dokonano także identyfikacji kierunków zmian co do wymogów wobec oferty usługowej przez turystów.


  • Doświadczenia w prowadzeniu projektów inwestycyjnych w branży wodociągowo - kanalizacyjnej realizowanych przy udziale środków Unii Europejskiej
    • Ziemowit Suligowski
    2011 Inżynieria Morska i Geotechnika

    Przegląd doświadczeń z projektami współfinansowanymi I konkursu. Braki w dokumentacji, powszechność braków dokumentacji zagopspodarowania przestrzennego. Główne zagrożenia. Podstawowe usterki opracowań projektowych.


  • Doświadczenia z eksploatacji pilotowej hydrofitowej oczyszczalni odcieków ze składowiska odpadów komunalnych w zależności od reżimu hydraulicznego
    • Ewa Wojciechowska
    2011 Full text Journal of Ecological Engineering

    W artykule przedstawiono doświadczenia z 2-letniej eksploatacji pilotowego obiektu hydrofitowego do oczyszczania odcieków ze składowiska odpadów komunalnych w Chlewnicy (woj. pomorskie). W skład obiektu wchodzi zbiornik początkowy odcieków oraz 3 złoża o przepływie podpowierzchniowym - w dwóch początkowych złożach przepływ ścieków jest pionowy (VSSF), w trzecim złożu zaś - poziomy (HSSF). Obiekt został uruchomiony w lipcu 2008. Po pierwszym okresie wypracowania (do końca jesieni 2008), w roku 2009 osiągnięto bardzo wysokie efektywności usuwania zanieczyszczeń, wynoszące 87% dla ChZT, 95,4% dla BZT5, ponad 99% dla azotu amonowego, 98% dla azotu ogólnego i 72% dla zawiesiny ogólnej. W sezonie wegetacyjnym 2010 zmieniono warunki hydrauliczne pracy obiektu, co spowodowało spadek efektywności usuwania zanieczyszczeń. Nastąpiło zahamowanie denitryfikacji na złożu HSSF. W pracy omówiono skład odcieków podawanych na złoża oraz efektywność ich oczyszczania w różnych warunkach hydraulicznych.