Publications Repository - Gdańsk University of Technology

Page settings

polski
Publications Repository
Gdańsk University of Technology

Show publications from the year

Publications from the year 2017

Show all
  • Modular power converter with superconducting magnetic energy storage for electric power distribution system — Analysis and simulation
    • Marcin Parchomiuk
    • Ryszard Strzelecki
    • Krzysztof Zymmer
    • Andrzej Domino
    2017

    This paper describes selected issues concerning realization of energy storage system (ESS) designed to operate in power distribution system. This paper presents a modular approach of 300 kVA power converter operating with superconducting magnetic energy storage (SMES), which gives high dynamics together with high power and suitable capability for instantaneous energy storage. Analysis and simulation studies of selected power converter topologies are conducted, which are also commonly used to connect electric power distribution system and energy storage system. In order to verify assumed technical parameters, a single prototype of ESS is presented together with experimental results. Proposed solution supports scalability of the system in power as well as in energy storage capacity of ESS. Presented full scale prototype module is a result of conducted analysis and proposition for future renewable energy storage installations

  • Moduł eksperymentalny do badania wężownicowych wymienników ciepła
    • Rafał Andrzejczyk
    • Tomasz Muszyński
    • Przemysław Kozak
    2017 Technika Chłodnicza i Klimatyzacyjna

    Artykuł dotyczy badań eksperymentalnych modułu do badania wężownicowych wymienników ciepła. Opracowanie zawiera przykłady zastosowania wymienników z wężownicami, opis stanowiska oraz wstępne badania.

  • Modyfikacja i optymalizacja konstrukcji elektrochemicznych czujników gazów toksycznych
    • Anna Strzelczyk
    2017

    W pracy przedstawiono wyniki badań mających na celu opracowanie konstrukcji i przebadanie właściwości elektrochemicznych czujników gazów. Badania dotyczyły amperometrycznego czujnika ditlenku siarki oraz czujnika elektrokatalitycznego wykorzystanego do pomiaru stężenia gazów toksycznych. Badany w pracy prototyp czujnika posiadał elektrodę pomiarową otrzymaną w wyniku chemicznego wytrącania złota w membranie nafionowej. Zbadano właściwości takiego czujnika pracującego z różnymi roztworami elektrolitów. Wyznaczono wartości czułości czujnika względem ditlenku siarki oraz określono jego selektywność względem innych gazów toksycznych. Przedstawione zostały również wyniki badań nad poprawą właściwości czujnika uzyskane dzięki zastosowaniu różnych metod pomiarowych. Czujniki elektrokatalityczne zbudowane są na bazie elektrolitów stałych. Informacja o mieszaninie gazów w otoczeniu czujnika zawarta jest w kształcie charakterystyki prądowo-napięciowej. Zbadano właściwości elektrokatalitycznego na bazie NASICONu w atmosferze powietrza zawierającego amoniak, ditlenek siarki i chlor. Prace obejmowały też badania czujników o nowej konstrukcji, tj.: z jedną z elektrod bez możliwości dostępu do gazu, z dodatkowymi warstwami, z użyciem nowego elektrolitu tytanianu litowo-lantanowego. Prace dotyczyły też możliwości zastosowania nowych technik pomiarowych dla tego typu czujników.

  • Modyfikacje polimeraz DNA jako rozwiązania problemów w reakcjach PCR
    • Marta Śpibida
    • Marcin Olszewski
    • Beata Krawczyk
    2017 Full text

    Reakcja PCR już od wielu lat jest podstawowym narzędziem stosowanym w biotechnologii molekularnej. Nadal napotykamy jednak liczne problemy podczas jej przeprowadzania związane z trudnymi matrycami, obecnością inhibitorów itp. Optymalizacja reakcji PCR jest więc niezbędna w celu poprawy wyników. Jednym z rozwiązań tych problemów może być modyfikowanie polimeraz DNA. W powyższym artykule opisano problemy i rozwiązania zależne polimerazy DNA. Opisano również powody, które uzasadniają potrzebę modyfikacji polimeraz DNA, rodzaje modyfikacji, a także podjęto próbę określenia wpływu tych zmian na końcową efektywność polimeraz.

  • Modyfikowane nanodiamentowe warstwy do sensorów z detekcją optyczną i elektrochemiczną
    • Michał Sobaszek
    2017 Full text

    W rozprawie doktorskiej przedstawiono opracowanie parametrów procesów syntezy osadzania z fazy gazowej wspomaganego plazmą mikrofalową (MWPACVD) do wytwarzania warstw nanodiamentowych o niskim współczynniku absorpcji optycznej i wysokiej przewodności elektrycznej. Warstwy te są przeznaczone do sensorów z detekcją optyczną i elektrochemiczną stosowanych w układzie interferometru Mach-Zehndera do badania in situ modyfikacji elektrod diamentowych oraz detekcji ważnych biologicznie związków organicznych. Praca dotyczy syntetycznych warstw nanodiamentowych domieszkowanych borem ponieważ takie struktury mają charakter półprzewodnikowy i mogą być stosowane do badań elektrochemicznych oraz optoelektronicznych. W celu detekcji istotnych biologicznie substancji organicznych oraz ocenie modyfikacji warstw nanodiamentowych zbudowano układ pomiarowy wykorzystujący zjawisko interferometrii. Zmiana współczynnika załamania światła będzie skorelowana z zachodzącym procesem elektrochemicznym. Efektem rozprawy doktorskiej jest nowe podejście do badań spektroelektrochemicznych wykorzystujących zjawisko interferometrii. Uzyskane wyniki potwierdzają możliwość diagnostyki w trubie in situ modyfikacji elektrod. Wykonano także, pomiary detekcji isatinu, który jest trudnym związkiem w klasycznej detekcji elektrochemicznej, dla stężeń 500, 100 oraz 10 μM.

  • Molecular basis and potential activity of HIV-1 reverse transcriptase toward trimethylamine-based compounds
    • Monikaben Padariya
    • Umesh Kalathiya
    • Maciej Bagiński
    2017 BIOTECHNOLOGY AND APPLIED BIOCHEMISTRY

    Reverse transcriptase (RT) inhibitors are currently used to treat human immunodeficiency virus (HIV)-1 infections. In this work, novel triethylamine derivatives were designed and studied by rigid and flexible docking and molecular dynamics (MD) approaches. An apo form of HIV-1 RT was also studied by MD simulation to analyze comparative response of protein in ligand-bound and ligand-unbound forms. Among newly designed HIV-1 RT inhibitors, compound HIV104 was the most potent inhibitor considering different docking results. Molecular docking results were further validated by MD simulations of an HIV-1 RT/HIV104 complex using two independent software (Discovery Studio Client 3.1 and GROMACS) to perform comparative analysis. Results suggest that hydroxyl and carboxyl groups present at –R1 position in compounds favored strong H-bond contacts as well as good interaction energy profile. Our MD results are consistent with the observations that conformational dynamics between the thumb and finger subdomains of HIV-1 RT controls its dynamics on substrate binding and subsequent activity. MD studies of HIV-1 RT/HIV104 provide insight into interrelatedness of residue scale interactions and global conformational change and also hint at the complex nature of allosteric inhibition. Thus, the results obtained from this study facilitate the design of potent HIV-1 RT inhibitors.

  • Molecular basis and quantitative assessment of TRF1 and TRF2 protein interactions with TIN2 and Apollo peptides
    • Umesh Kalathiya
    • Monikaben Padariya
    • Maciej Bagiński
    2017 Full text EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS

    Shelterin is a six-protein complex (TRF1, TRF2, POT1, RAP1, TIN2, and TPP1) that also functions in smaller subsets in regulation and protection of human telomeres. Two closely related proteins, TRF1 and TRF2, make high-affinity contact directly with double-stranded telomeric DNA and serve as a molecular platform. Protein TIN2 binds to TRF1 and TRF2 dimer-forming domains, whereas Apollo makes interaction only with TRF2. To elucidate the molecular basis of these interactions, we employed molecular dynamics (MD) simulations of TRF1TRFH-TIN2TBM and TRF2TRFH-TIN2TBM/ApolloTBM complexes and of the isolated proteins. MD enabled a structural and dynamical comparison of protein–peptide complexes including H-bond interactions and interfacial residues that may regulate TRF protein binding to the given peptides, especially focusing on interactions described in crystallographic data. Residues with a selective function in both TRF1TRFH and TRF2TRFH and forming a stable hydrogen bond network with TIN2TBM or ApolloTBM peptides were traced. Our study revealed that TIN2TBM forms a well-defined binding mode with TRF1TRFH as compared to TRF2TRFH, and that the binding pocket of TIN2TBM is deeper for TRF2TRFH protein than ApolloTBM. The MD data provide a basis for the reinterpretation of mutational data obtained in crystallographic work for the TRF proteins. Together, the previously determined X-ray structure and our MD provide a detailed view of the TRF–peptide binding mode and the structure of TRF1/2 binding pockets. Particular TRF–peptide interactions are very specific for the formation of each protein–peptide complex, identifying TRF proteins as potential targets for the design of inhibitors/ drugs modulating telomere machinery for anticancer therapy.

  • Molecular basis for the DNA damage induction and anticancer activity of asymmetrically substituted anthrapyridazone PDZ-7
    • Majus Misiak
    • Mateusz Heldt
    • Marlena Szeligowska
    • Stefania Mazzini
    • Leonardo Scaglioni
    • Grzegorz Jan Grabe
    • Marcin Serocki
    • Jan Jakub Lica
    • Marta Świtalska
    • Joanna Wietrzyk
    • Giovanni Beretta
    • Paola Perego
    • Dominik Ziętkowski
    • Maciej Bagiński
    • Edward Borowski
    • Andrzej Składanowski
    2017 Full text Oncotarget

    nthrapyridazones, imino analogues of anthraquinone, constitute a family of compounds with remarkable anti-cancer activity. To date, over 20 derivatives were studied, of which most displayed nanomolar cytotoxicity towards broad spectrum of cancer cells, including breast, prostate and leukemic ones. BS-154, the most potent derivative, had IC50 values close to 1 nM, however, it was toxic in animal studies. Here, we characterize another anthrapyridazone, PDZ-7, which retains high cytotoxicity while being well tolerated in mice. PDZ-7 is also active in vivo against anthracycline-resistant tumor in a mouse xenograft model and induces DNA damage in proliferating cells, preferentially targeting cells in S and G2 phases of the cell cycle. Activation of Mre11-Rad50-Nbs1 (MRN) complex and phosphorylation of H2AX suggest double-stranded DNA breaks as a major consequence of PDZ-7 treatment. Consistent with this, PDZ-7 treatment blocked DNA synthesis and resulted in cell cycle arrest in late S and G2 phases. Analysis of topoisomerase IIα activity and isolation of the stabilized covalent topoisomerase IIα - DNA complex in the presence of PDZ-7 suggests that this compound is a topoisomerase IIα poison. Moreover, PDZ-7 interfered with actin polymerization, thereby implying its action as a dual inhibitor of processes critical for dividing cells. Using nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy we show that PDZ-7 interacts with DNA double helix and quadruplex DNA structure. Taken together, our results suggest that PDZ-7 is a unique compound targeting actin cytoskeleton and DNA.

  • Molecular mobility of water protons under interaction with chemically modified starches. DSC and HMR-relaxation investigations
    • A.i. Sergeev
    • N.g. Szilkina
    • L.a Wasserman
    • C.i. Szilow
    • Hanna Staroszczyk
    2017 Full text Fizyka Chemiczna [czas. rosyjskojęzyczne]

    The change of water protons mobility in the system chemically modified starches – water were investigated by DSC and NMR-relaxation methods. The amount of unfrozen water at subzero temperature as well as additional unfrozen water which appears after gelatinization have lower values for chemically modified starches in comparison with the native starch. The proton spin-spin relaxation time Т2 for chemically modified starch samples, conventionally referred to the fraction of water inside the starch granules, are monotonically decreasing at heating, while for the native starch this dependence has extreme character. The study of dispersion of 7% gels, characterizing the rate of chemical exchange of water protons with the protons of hydroxyl groups of polysaccharides, demonstrated the absence of such dependence for chemically modified starches at the operating frequency of measuring device 20 МHz. Received data suggest considerable destructive changes in chemically modified starches structure.

  • Molecular Targets for Anticandidal Chemotherapy
    • Sławomir Milewski
    2017

    A relatively small number of anticandidal chemotherapeutics used in clinical practice is at least in part consequence of a limited number of their molecular targets: ergosterol in the membrane, lanosterol demethylase, b(1!3) glucan synthase, and DNA/RNA biosynthesis. Much more potential novel targets have been revealed by the comparative genomic studies identifying essential genes unique for Candida albicans or resulted from recognition of biomolecules targeted by newly discovered antifungals of natural or synthetic origin. The most promising of them are proteins/enzymes involved in biosynthesis of the cell wall components: chitin synthase, O-mannosyl tranferase, a-1,2 mannosyltransferases, and inositol acylase, in biosynthesis of membrane lipids (Eq. inositolphosphoceramide synthase), in methonine biosynthesis, in translation and posttranslation processing (fungal-specific elongation factors, N-mirystoyl transferase) and in signaling pathways. Target candidates have been also identified among proteins participating in expression of C. albicans virulence factors: filamentation, biofilm formation, and production of secretory hydrolytic enzymes.

  • Monitoring dojrzewania betonu skrzynki mostu MS3/B DK-16 - sekcja S3.18P
    • Krzysztof Wilde
    • Aleksandra Kuryłowicz-Cudowska
    • Marzena Kurpińska
    • Błażej Meronk
    • Mikołaj Miśkiewicz
    • Jacek Chróścielewski
    • Agnieszka Sabik
    • Michał Groth
    2017

    Celem niniejszego opracowania jest przeprowadzenie badań modułów sprężystości betonu klasy C60/75 oraz monitoring zmian temperaturowych w wybranych punktach sekcji S3.18P. System pomiaru temperatury służy także do wyznaczenia rzeczywistych wytrzymałości betonu w trakcie dojrzewania, sformułowania wskazówek dotyczących terminów demontażu deskowań lub weryfikacji terminów rozpoczęcia procesu sprężania konstrukcji.

  • Monitoring of the Process of System Information Broadcasting in Time
    • Piotr Andrzej Mironowicz
    • Jarosław Korbicz
    • Paweł Horodecki
    2017 PHYSICAL REVIEW LETTERS

    One of the problems of quantum physics is how a measurement turns quantum, noncopyable data, towards copyable classical knowledge. We use the quantum state discrimination in a central system model to show how its evolution leads to the broadcasting of the information, and how orthogonalization and decoherence factors allow us to monitor the distance of the state in question to the one perfectly broadcasting information, in any moment of time not just asymptotically. We illustrate this in the spin-spin model where the distance is shown to be typically small and provide the related time scales.

  • Monitoring system of the road embankment
    • Mikołaj Miśkiewicz
    • Błażej Meronk
    • Tadeusz Brzozowski
    • Krzysztof Wilde
    2017 Full text

    The paper presents the monitoring system of the embankment supported on concrete columns and overlaid by a load transfer platform (LTP) with the embedded steel grid. This field investigation was to study the complex inter-action between the columns, the LTP layer, and steel reinforcement via full-scale in situ measurements during erection of the embankment. The study was focused on the behaviour of steel reinforcement and the behaviour of the outer rows of columns since there are limited reference data available for this problem. The system was designed to provide infor-mation to engineers about the condition of the embankment at every stage of construction and during standard exploi-tation of road. The measurements provided information about the changes of strains of steel grid and concrete columns and settlement of the structure.

  • MONITORING SYSTEM OF THE ROAD EMBANKMENT
    • Mikołaj Miśkiewicz
    • Błażej Meronk
    • Tadeusz Brzozowski
    • Krzysztof Wilde
    2017 Full text Baltic Journal of Road and Bridge Engineering

    The paper presents the analysis of the monitoring system of the embankment supported on concrete columns and overlaid by a load transfer platform with the embedded steel grid. This field investigation was to study the complex interaction among the columns, the load transfer platform layer, and steel grid via in situ measurements during erection and live loading of the embankment. The study was focused on the behaviour of steel grid and the behaviour of the outer rows of columns since there are limited reference data available for this problem. The system was designed to inform the engineers about the condition of the embankment at every stage of construction and during standard operation of the road. The measurements brought the information on strain variations of steel grid, concrete columns, and structural settlement and provided necessary evidence for the embankment numerical model validation.

  • Monitorowanie szybkości korozji oraz dobór materiałów konstrukcyjnych w instalacji wody morskiej platformy Baltic Beta
    • Kazimierz Darowicki
    • Juliusz Orlikowski
    • Agata Jażdżewska
    • Tadeusz Sonneck
    • Andrzej Dul
    2017

    Wykonano analizę szybkości korozji systemu monitorowania korozji z okresu od 25.11.2016 do 12.07.2017. Zdemontowano czujnik korozyjny w instalacji wody morskiej, Zainstalowani nowy czujnik z opcją pomiaru szybkości korozji metodą kuponową. Monitoringiem poddano następujące materiały: 1.7362, 1.5415, 1.0038

  • Morphometric evaluation of the delayed cerebral arteries response to acetazolamide test in patients with chronic carotid artery stenosis using computed tomography angiography
    • Arkadiusz Szarmach
    • Paweł J. Winklewski
    • Grzegorz Halena
    • Mariusz Franciszek Kaszubowski
    • Jarosław Dzierżanowski
    • Maciej Piskunowicz
    • Edyta Szurowska
    • Andrzej Frydrychowski
    2017 Full text Folia Morphologica

    Background: The evidence accumulates that the response to acetazolamide test is delayed on the ipsilateral side to stenosis. However, the effect of acetazolamide beyond 30 minutes after acetazolamide administration remains unknown. The aim of this study was to assess the diameters of: anterior cerebral arteries (ACAs), middle cerebral arteries (MCAs) and posterior cerebral arteries (PCAs) before and 60 minutes after the acetazolamide test. Materials and Methods: Seventeen patients with carotid artery stenosis ≥90% on the ipsilateral side and, ≤50% on the contralateral side were enrolled into the study. Diagnosis was based on ultrasonography examination and was confirmed using digital subtractive angiography. In all patients, two computed tomography angiography examinations were carried out; the first was performed before the acetazolamide administration while the second one was carried out 60 minutes after injections. Results: In response to the acetazolamide test: PCA diameter diminished in both ipsi- and contra- lateral side to stenosis (from 1.31 to 1.24 mm and from 1.23 to 1.15, respectively), ACA and MCA decreased in the contralateral side to the stenosis (from 1.33 to 1.26 and from 2.75 to 2.66 mm, respectively), ACA and MCA increased in the ipsilateral side to the stenosis (from 1.29 to 1.46 mm and from 2.77 to 2.96, respectively). All changes were statistically significant. Conclusions: There were significant differences in reactivity to acetazolamide challenge between the internal carotid artery (ICA) and vertebra-basilar circulation in patients suffering from chronic carotid artery stenosis. Within the ICA territory ACAs and MCAs responses vary in the affected and not affected side.

  • MOST CŁOWY W SZCZECINIE – AWARIA, KTÓRA PRZESĄDZIŁA O PRZYSZŁOŚCI KONSTRUKCJI SPRĘŻONEJ
    • Krzysztof Żółtowski
    • Mikołaj Binczyk
    2017

    W referacie przedstawiono historię budowy i eksploatacji Mostu Cłowego w Szczecinie. W okresie 56 lat eksploatacji obiektu wykonano szereg ekspertyz, napraw i remontów. Ostatecznie most został zamknięty z powodu poważnej awarii stalowych kabli sprężenia zewnętrznego. Przedstawione zostały główne przyczyny degradacji obiektu i awarii. Opisano również obliczenia statyczne i wytrzyma- łościowe wykonane do koncepcji rozbiórki przęseł mostu.

  • MOST PODWIESZONY kreowanie przestrzeni i konsekwencje konstrukcyjne
    • Krzysztof Żółtowski
    2017 Full text Builder

    Projektowanie i budowa - wyzwania dla projektantów i wykonawców mostów. Mosty podwieszone i wiszące ich estetyka i konsekwencje strukturalne. Artykuł dotyczy aspektów estetycznych i konstrukcyjnych zaprojektowanych pylonów dla mostów podwieszonych lub wiszących. Autor zwraca uwagę na fakt, że niezwykłe rozwiązanie konstrukcyjne zastosowane do kładki lub małego wiaduktu może działać prawidłowo dzięki zjawiskom efektu skali. Nadzwyczajne rozwiązanie konstrukcyjne zaimplementowane jako estetyczne elementy dużego mostu może stwarzać poważne problemy z ogólną nośnością konstrukcji lub co najmniej czyni ją niezwykle kosztowną. Przedstawiono i omówiono kilka przykładów.

  • MOST Wiedzy jako narzędzie promocji otwartych zasobów nauki
    • Paweł Lubomski
    2017 Full text Zeszyty Naukowe Wydziału Elektrotechniki i Automatyki Politechniki Gdańskiej

    Rośnie znaczenie wiedzy zgromadzonej w różnego rodzaju systemach, w tym w kursach on-line. Połączenie systemów je przetwarzających z Internetem w znaczącym stopniu usprawniło rozprzestrzenianie informacji i zwiększyło jej dostępność. Coraz szersze uznanie zyskują ruchy Otwartego Dostępu (ang. Open Access). Politechnika Gdańska w ramach projektu Multidyscyplinarny Otwarty System Transferu Wiedzy – MOST Wiedzy buduje platformę o tej samej nazwie, która ma na celu udostępnienie w trybie Otwartego Dostępu zasobów nauki opracowanych na Uczelni. Celem tego działania jest szerokie wypromowanie potencjału badawczego i edukacyjnego Uczelni oraz jej pracowników. Usprawni to organizację międzynarodowych multidyscyplinarnych zespołów i projektów badawczych oraz nawiązywanie współpracy nauka – biznes w zakresie wykorzystania potencjału uczelni oraz komercjalizacji innowacji.

  • MOST Wiedzy jako narzędzie promocji potencjału naukowo-badawczego uczelni wyższej
    • Paweł Lubomski
    2017 Full text EduAkcja. Magazyn Edukacji Elektronicznej

    Rozwój Internetu wpłynął na wiele aspektów naszego życia. Pośród wielu z nich zrewolucjonizował sposób komunikacji. Pochodną tego jest zmiana sposobu przekazywania wszelkiego rodzaju wiedzy. Ogromne znaczenie mają przeszukiwane źródła wiedzy, ich jakość i dostępność. W związku z tym, w obecnych czasach, o potencjale naukowym uczelni wyższej stanowią, obok pracowników w nich zatrudnionych, przede wszystkim zgromadzone bazy wiedzy będące efektem ich działalności. Coraz szersze uznanie zyskują ruchy otwartego dostępu (ang. open access) wpisujące się w szerszą inicjatywę otwartej nauki (ang. open science) i będące odpowiedzią na problemy z dostępem do wyników przeprowadzanych badań. Politechnika Gdańska rozpoczęła realizację projektu Multidyscyplinarny Otwarty System Transferu Wiedzy – MOST Wiedzy, w ramach którego będzie udostępniać w trybie otwartego dostępu opracowane na Uczelni zasoby nauki. Platforma MOST Wiedzy to nowoczesne rozwiązanie technologiczne zintegrowane z licznymi zewnętrznymi systemami. Zapewnienie odpowiedniej jakości przetwarzanych danych oraz szeroka otwartość i dostępność zgromadzonych na platformie MOST Wiedzy zasobów w znacznym stopniu usprawni przepływ wiedzy, będzie promować potencjał naukowo-badawczy i edukacyjny Uczelni oraz ułatwi nawiązywanie relacji na linii nauka-nauka i nauka-biznes, a w efekcie powstawanie nowych rozwiązań o charakterze innowacyjnym i komercyjnym.