Fungi of the Scopulariopsis genus, commonly found in the environment, are opportunistic pathogens that can cause various types of human infections. So far, no efficient molecular method has been developed for species differentiation among Scopulariopsis and related genera. In order to advance this field, we have evaluated performance of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays, based on cytochrome c oxidase subunit 1 and β-tubulin genes. The assays resulted in 2–10 restriction patterns, depending on the gene amplified and restriction enzyme applied. Pooled analysis of the patterns allowed to propose an algorithm, that can be successfully used for an accurate species-specific identification of 21 species of the Scopulariopsis-like fungi.
Autorzy
- Milena Kordalewska,
- Jolanta Kalita,
- Zofia Bakuła,
- dr hab. inż. Anna Brillowska-Dąbrowska link otwiera się w nowej karcie ,
- Tomasz Jagielski
Informacje dodatkowe
- DOI
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego link otwiera się w nowej karcie 10.1093/mmy/myy106
- Kategoria
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Język
- angielski
- Rok wydania
- 2019