Repozytorium publikacji - Politechnika Gdańska

Ustawienia strony

english
Repozytorium publikacji
Politechniki Gdańskiej

Publikacje z roku 2012

Pokaż wszystkie
  • Genetic Positioning of Fire Stations Utilizing Grid-computing Platform
    • Jerzy Balicki
    • Waldemar Korłub
    • Henryk Krawczyk
    2012

    A chapter presents a model for determining near-optimal locations of fire stations based on topography of a given area and location of forests, rivers, lakes and other elements of the site. The model is based on principals of genetic algorithms and utilizes the power of the grid to distribute and execute in parallel most performance-demanding computations involved in the algorithm.


  • Genetic predisposition to inflammatory bowel disease
    • Bartłomiej Ferra
    • Magdalena Góra-Gębka
    • Roman Kotłowski
    • Lucyna Holec-Gąsior
    • Dorota Drapała
    2012 Acta Biochimica Polonica

    Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic, incurable inflammatory disease of the digestive system. The two main disease entities included in the IBD are ulcerative colitis and Crohn's disease. According to epidemiological studies there are more and more new cases every year. In especially among the youngest patients with symptoms of malnutrition and growth inhibition to land up in hospitalwith cancer suspected. The purpose of this study was to determine the genetic predisposition of the disease in the population of children. On the literature study basis there were genes slc11a1, irgm and atg16l1 selected and analyzed. The proteins encoded by these genes probably play a key role in the process of phagocytosis and autophagocytosis. They also interact with other components of the immune system and their dysfunction can lead to inflammation. The study was conducted on a selected group of 77 patients with confirmed IBD and 79 control patients. We used PCR-RFLP technique to detect point mutations, deletions and insertions within the promoter sequence, untranslated region (UTR) and ORF sequences.


  • Genetic programming extension to APF-based monocular human body pose estimation
    • Piotr Szczuko
    2012 Pełny tekst MULTIMEDIA TOOLS AND APPLICATIONS

    New method of the human body pose estimation based on a single camera 2D observation is presented, aimed at smart surveillance related video analysis and action recognition. It employs 3D model of the human body, and genetic algorithm combined with annealed particle filter for searching the global optimum of model state, best matching the object's 2D observation. Additionally, new motion cost metric is employed, considering current pose and history of the body movement, favouring the estimates with the lowest changes of motion speed comparing to previous poses. The "genetic memory" concept is introduced for the genetic processing of both current and past states of 3D model. State-of-the-art in the field of human body tracking is presented and discussed. Details of implemented method are described. Results of experimental evaluation of developed algorithm are included and discussed.W rozdziale przedstawiono nową metodę estymacji układu ciała użytkownika obserwowanego przez jedną kamerę wizyjną. Wykorzystany jest model trójwymiarowy ciała ludzkiego, którego stan modyfikowany jest algorytmem wyżarzanej filtracji cząsteczkowej z proponowaną modyfikacją genetyczną, w celu optymalizacji stopnia podobieństwa model z aktualną sylwetką ludzką. Ponadto zaproponowano nową metrykę kosztu ruchu, uwzględniającą obecną pozę i ''historię genetyczną'' poprzednich póz. Przedstawiono przegląd i analizę obecnych metod, udokumentowano proponowaną metodę i zweryfikowano efekty jej działania.


  • Genetic Programming for Workload Balancing in the Comcute Grid System
    • Jerzy Balicki
    • Waldemar Korłub
    • Jacek Paluszak
    • Artur Zacniewski
    2012

    A genetic programming paradigm is implemented for reliability optimization in the Comcute grid system design. Chromosomes are generated as the program functions and then genetic operators are applied for finding Pareto-suboptimal task assignment and scheduling. Results are compared with outcomes obtained by an adaptive evolutionary algorithm.


  • Genetycznie modyfikowane mikroorganizmy narzędziem służącym do usuwania metali ciężkich ze środowiska
    • Michał Banasik
    2012

    Metale ciężkie są pierwiastkami metalicznymi i półmetalicznymi o gęstości powyżej 4,5 g•cm-3. Powodują zaburzenia w strukturze DNA, mogą być przyczyną chorób nowotworowych, układu nerwowego, pokarmowego, naczyniowego i kostnego. Wykorzystywane są w przemyśle chemicznym, elektromaszynowym, szklarskim, metalurgicznym, farbiarskim, wydobywczym, energetyce jądrowej. Wiele metali, takich jak kobalt, miedź, nikiel, stanowi mikroelementy niezbędne organizmom do prowadzenia reakcji redox, stabilizacji biocząsteczek, regulacji ciśnienia osmotycznego i jako kofaktory enzymów. Jony metali, nie pełniące funkcji biologicznych, są toksyczne dla komórki, gdyż wiążą się z wysokim powinowactwem z jej składnikami. W wysokim stężeniu, zarówno jony metali będących mikroelementami jak i metali jej zbędnych, mogą stanowić zagrożenie. Skutki działania na komórkę tego typu trucizn to uszkodzenie osłon komórkowych, enzymów i DNA. Istnieje sześć rodzajów mechanizmów obronnych przeciwko jonom metali ciężkich: zmiana struktury błon półprzepuszczalnych, dzięki czemu jony metali nie wnikają do cytozolu, unieruchomienie jonów wewnątrz lub na zewnątrz komórki, eksport jonów z cytozolu na drodze transportu aktywnego, enzymatyczna detoksyfikacja i zmniejszenie wrażliwości samej komórki na działanie jonów metali ciężkich.Tradycyjne techniki stosowane do usuwania z wód i gleb metali ciężkich wykazują niską specyficzność i wrażliwość na panujące warunki takie jak pH, siła jonowa, obecność związków chelatujących. Wykorzystanie w bioremediacji bakteryjnych mechanizmów oporności na metale ciężkie może być ciekawą alternatywą. Skonstruowano rekombinantowe szczepy bakteryjne zdolne do pobierania do wnętrza komórki (bioakumulacji) jak również adsorpcji na jej powierzchni (biosorpcji) metali ciężkich ze środowiska z wysoką wydajnością. Mimo wielu potencjalnych zalet wykorzystania genetycznie modyfikowanych mikroorganizmów w procesach usuwania metali ciężkich ze ścieków, wód i gleb nie są one wykorzystywane na skalę przemysłową. Główny problem to trudność prowadzenia tych procesów w sposób ciągły. Genetycznie modyfikowane bakterie nie wymagają do wzrostu dodatkowych, drogich substratów, zaś ścieki przemysłowe są zwykle bogate w związki organiczne zapewniając mikroorganizmom niezbędne do wzrostu składniki odżywcze, pozwalające na zachowanie specyficzności usuwania jonów danego metalu przy jednoczesnym wzroście biomasy.


  • Genotyping Techniques for Determining the Diversity of Microorganisms
    • Katarzyna Wolska
    • Piotr Szweda
    2012

    Typing of microbial pathogens, or identifying bacteria at the strain level, is particularly important for diagnosis, treatment, and epidemiological surveillance of bacterial infections. This is especially the case for bacteria exhibiting high levels of antibiotic resistance or virulence, and those involved in nosocomial or pandemic infections. Strain typing also has applications in studying bacterial population dynamics. The part that molecular methods have to play in elucidating bacterial diversity is increasingly important. The shortcomings of phenotypically based typing methods (generally these methods are viewed as being too time consuming and lacking in sufficient resolution amongst related strains) have led to the development of many DNA - based techniques. A suitable typing method must have high discrimination power combined with good to moderate inter- and intra-laboratory reproducibility. In addition, it should be easy to set up, to use and to interpret, and inexpensive (Olive & Bean, 1999). In this chapter, we review the current bacterial genotyping methods and classify them into six main categories: (1 and 2) DNA banding pattern-based methods, which classify bacteria according to the size of fragments generated respectively by enzymatic digestion of genomic/plasmid DNA, and PCR amplification, (3) DNA hybridization-based methods using nucleotidic probes, (4) DNA sequencing-based methods, which study the polymorphism of DNA sequences, (5) differentiation of isolates on the basis of presence or absence of particular genes and (6) high resolution melting analysis-real-time monitoring of melting process of PCR amplified polymorphic DNA fragment. We described and compared the applications of genotyping methods to the study of bacterial strain diversity. We also discussed the selection of appropriate genotyping methods and the challenges of bacterial strain typing and described the current trends of genotyping methods


  • Gentiana asclepiadea exerts antioxidant activity and enhances DNA repair of hydrogen peroxide- and silver nanoparticles-induced DNA damage
    • Alexandra Hudecova
    • Barbara Kusznierewicz
    • Katarina Hasplova
    • Anna Huk
    • Zuzana Magdolenova
    • Eva Miadokova
    • Eliska Galova
    • Maria Dusinska
    2012 Pełny tekst FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY

    Exposure to high levels of different environmental pollutants is known to be associated with induction of DNA damage in humans. Thus DNA repair is of great importance in preventing mutations and contributes crucially to the prevention of cancer. In our study we have focused on quantitative analysis of Gentiana asclepiadea aqueous or methanolic extracts obtained from flower and haulm, their antioxidant potency in ABTS post-column derivatisation, and their potential ability to enhance DNA repair in human lymphocytesafter hydrogen peroxide (H2O2) treatment (250 lM, 5 min). We also studied DNA repair in human kidney HEK 293 cells after exposure to 20 nm silver nanoparticles (AgNPs) (100 lg/ml, 30 min) in the presence and absence of the plant extract. We have found that mangiferin along with unidentified polar compounds are the most pronounced antioxidants in the studied extracts. Extract from haulm exhibited slightly stronger antioxidant properties compared to flower extracts. However, all four extracts showed significant ability to enhance DNA repair in both cell types after H2O2 and AgNP treatments.


  • Geoinformation technologies in the identification of meandering section of the river
    • Beata Wieczorek
    • Katarzyna Glińska-Lewczuk
    • Anna Sobieraj-Żłobińska
    2012

    Publikacja traktuje o wykorzystaniu naziemnego skaningu laserowego dla potrzeb analiz przestrzennych w zakresie meandrowania rzeki.


  • Gęstość usieciowania, właściwości termiczne oraz morfologia wulkanizatów SBR-dewulkanizat o różnej całkowitej zawartości sadzy
    • Krzysztof Formela
    • Józef Haponiuk
    • Przemysław Stankiewicz
    • Magdalena Formela
    • Marta Chojnacka
    2012 Przemysł Chemiczny

    Przedstawiono wyniki badań wpływu zawartości sadzy na właściwości usieciowanych mieszanin kauczuku butadienowo-styrenowego i dewulkanizatu gumowego otrzymanego metodą ciągłą, przy użyciu wytłaczarki dwuślimakowej współbieżnej. Scharakteryzowano zależności pomiędzy sumaryczną ilością sadzy, stanowiącą sumę sadzy dodawanej i sadzy zawartej w dewulkanizacie gumowym na gęstość usieciowania, dynamiczne właściwości mechaniczne, odporność termiczną oraz morfologię uzyskanych produktów.


  • Glikoliza poliuretanów
    • Janusz Datta
    2012

    W pracy przedstawiłem wyniki badań procesu glikolizy odpadowych materiałów polieterouretanowych i poliestrouretanowych oraz wytworzonych z ich udziałem lanych elastomerów uretanowych.Zbadałem wpływ stosunku masowego poliuretanu do glikolu, rodzaju glikolu użytego jako środka glikolizującego oraz rodzaju katalizatora na właściwości fizykochemiczne, reologię oraz budowę chemiczną i odporność termiczną wytworzonych półproduktów (glikolizatów). W pracy wykazałem także możliwość wykorzystania glikolizatówzarówno jako środków przedłużających, jak i składników prepolimerów do wytwrzania elastomerów poliuretanowych.


  • Good practices in requirements, project and risk managment in educational IT projects
    • Paweł Syty
    • Małgorzata Płotka
    2012

    One can find many learning aids and simulations of physical phenomena on the market - provided as a standalone application or as part of an educational package. However, only a few of them allow for the building of interactive experiments: experiments similar to those that should be conducted in physics laboratories at schools. Gdańsk University of Technology decided to fill this market niche by designing and constructing a set of virtual experiments - so called e-experiments. To avoid common problems that a lot of IT products brought to defeat, they prepared procedures in accordance with the best practices of software engineering. The paper below describes the process of the e-experiments development paying special attention to requirement, project and risk management. Authors try to prove that by not escaping from difficult matters such as carefully planning and risk analysis success can and will be achieved.


  • GPS-derived height changes in diurnal and sub-diurnal timescales
    • Janusz Bogusz
    • Mariusz Figurski
    2012 Acta Geophysica

    This paper describes the research concerning precise short-time GPS solutions conducted in the Centre of Applied Geomatics, Military University of Technology, Warsaw, Poland. The data from ASG-EUPOS (Polish Active Geodetic Network) was processed using Bernese 5.0 software and EPN (EUREF Permanent Network) standards and models. In this study, the adapted 3-hour observation window is shifted every hour for obtaining hourly geocentric coordinates in ITRF2005 reference frame. The adjusted network consisted of over 130 stations from Poland and the neighbouring countries, the period covered observations collected from June 2008 through June 2010. These two years of observations allowed for examining short-period oscillations which were found to be closely related to the tidal (dynamic) frequencies. The analysis of the residua from the IERS2003 tidal model was performed using the least squares method with the Eterna software. It confirmed the existence of significant (several millimetres) oscillations in the frequencies corresponding to S1, K1 and K2. The paper describes the idea of data processing and analysis, presents the results of vertical (the Up component) oscillations in main tidal frequency bands, and also includes discussion of possible explanation of the existence of short-period oscillations in the GPS precise solutions and the possibility of propagation of short-period oscillations into long-period spurious changes in the daily (standard) GPS solutions.


  • Grain type and size of particulate matter from diesel vehicle exhausts analysed in transmission electron microscopy
    • Przemysław Sielicki
    • Helena Janik
    • Agnieszka Guzman - Sielicka
    • Jacek Namieśnik
    2012 ENVIRONMENTAL TECHNOLOGY

    The aim of this research was to apply a simple and quick method of size and shape characterization by TEM to diesel exhaust particles from large-capacity, high-performance trucks. Particulate matter (PM) samples were collected while the engines were idling. It was found that PM from vehicle exhaust emissions can be divided into three groups: soot, irregular-shaped particles and circular particles. Irregular-shaped particles and soot aggregates were present in the exhausts of the three types of vehicle tested. Circular particles were identified only in the samples collected from exhaust emissions from the MAN vehicle, and were present in small amounts. The average surface area was in the range of 0.06 microm2 to 0.24 microm2. Mean perimeter fluctuated from 2.09 microm to 4.14 microm, and Feret diameter from 0.21 microm to 0.31 microm. Circularity was in the range of 0.12 to 0.30. Aspect ratio was around 0.30 to 0.45. Feret diameter seems to be a good parameter to define the mean size of particles, but does not take into account the influence of the shape. Therefore, this measurement seems to be useful just in the case of spherical or very rounded particles, not for all diesel PM. Thus, it is necessary to consider circularity or aspect ratio for DPM characterization. This work was supported by the Ministry of Higher Education and Science under the grant no. NN305 366338.


  • Graph Decomposition for Memoryless Periodic Exploration
    • Adrian Kosowski
    • Alfredo Navarra
    2012 ALGORITHMICA

    We consider a general framework in which a memoryless robot periodically explores all the nodes of a connected anonymous graph by following local information available at each vertex. For each vertex v, the endpoints of all edges adjacent to v are assigned unique labels within the range 1 to deg (v) (the degree of v). The generic exploration strategy is implemented using a right-hand-rule transition function: after entering vertex v via the edge labeled i, the robot proceeds with its exploration, leaving via the edge having label [i mod deg (v)]+1 at v.A lot of attention has been given to the problem of labeling the graph so as to achieve a periodic exploration having the minimum possible length π. It has recently been proved (Czyzowicz et al., Proc. SIROCCO'09, 2009) that π ≤ 13/3 n holds for all graphs of n vertices. Herein, we provide a new labeling scheme which leads to shorter exploration cycles, improving the general bound to π≤4n−2. This main result is shown to be tight with respect to the class of labellings admitting certain connectivity properties. The labeling scheme is based on a new graph decomposition which may be of independent interest.


  • Green Analytical Chemistry Approaches in Sample Preparation
    • Marek Tobiszewski
    • Agata Mechlińska
    • Jacek Namieśnik
    2012

    This chapter presents environmentally friendly solutions for sample preparation. Attention is focused on extraction techniques and the minimization of organic solvent consumption, as the large quantitiesused in analytical laboratories are a pressing environmental problem. Solventless sample preparation techniques, alternative solvents, mediated extractions are discussed. The principle of each technique isbriefly described, together with its main areas of application and some of its analytical parameters.


  • Green aspects of techniques for the determination of pesticides in fruits and vegetables
    • Jolanta Stocka
    • Maciej Tankiewicz
    2012

    Applied all over the world, pesticides are some of the most dangerous pollutants of the environment because of their stability, mobility, their ability to accumulate in the environment and their consequent long-term adverse effects on living organisms in general and human health in particular. Their presence in the environment is a particular danger. It is therefore crucial to monitor pesticide residues using all available analytical methods. The analysis of environmental samples for the presence of pesticides is very difficult: the processes involved in sample preparation are labour-intensive and time-consuming. To date, it has been standard practice to use large quantities of organic solvents in the sample preparation process; but as these solvents are themselves hazardous, solventless and solvent-minimized techniques are coming into use. The application of Green Chemistry principles to sample preparation leads above all to the miniaturization of procedures and the use of solventless techniques, and these are discussed in the paper.


  • Green Geotechnics in practice and theory
    • Zbigniew Sikora
    • Tomasz Szczygielski
    • Rafał Ossowski
    2012

    W artykule przedstawiono analizę wykorzystania materiałów antropogenicznych (głównie ubocznych produktów spalania) w drogownictwie na przykładzie Polski. Główny nacisk położono na analizę technologii w aspekcie emisyjności CO2. Zdaniem autorów technologie niskoemisyjne powinny mieć priorytet ''stosowalności'' - zwłaszcza w świetle ustaleń tzw. Protokołu z Kioto 2005. Geotechnika przyjazna środowisku, czyli tzw. Zielona Geotechnika, jest koniecznością w XXI wieku.


  • Grupowanie i ocena parametrów elektryczno ruchowych trolejbusowego układu zasilania metodą analizy głównych składowych
    • Mikołaj Bartłomiejczyk
    2012

    Jednym z podstawowych typów badań i analiz wykonywanych w różnych gałęziach nauki są analizy porównawcze. W tego typu badaniach mamy do czynienia z wieloma obiektami, które są charakteryzowane za pomocą różnych parametrów, często wyrażonych w różnych jednostkach fizycznych. Celem wielowymiarowej analizy porównawczej jest znalezienie zależności pomiędzy parametrami poszczególnych obiektów i ich grupowanie na podstawie podobieństw. Celem artykułu jest wskazanie na możliwość zastosowania metod wielowymiarowej analizy porównawczej także w zakresie nauk technicznych. Przedmiotem analizy jest układ zasilania sieci trolejbusowej, dla którego przeprowadzono wielowymiarową analizę parametrów elektryczno ruchowych.