Repozytorium publikacji - Politechnika Gdańska

Ustawienia strony

english
Repozytorium publikacji
Politechniki Gdańskiej

Publikacje z roku 2010

Pokaż wszystkie
  • Structural properties of hydration shell around various conformations of simple polypeptides
    • Dariusz Czapiewski
    • Jan Zielkiewicz
    2010 JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B

    In this paper we investigate structural properties of water within the solvation shell around the peptide core created by a well-defined conformation of polypeptide chain. The following secondary structures are investigated: linear (straight chain), and three helices PII (polyproline-like), 310, and α. We propose using the two-particle contribution to entropy as a rational measure of the water structural ordering within the solvation layer. This contribution divides into two terms, depending on the peptide−water and water−water interactions, respectively, and in this paper both terms are investigated. The structure of "solvation" water is described by the second term, and therefore it mainly attracts our attention. Determination of this term, however, is not an easy task, requiring some controversial approximations. Therefore, we have transformed this term to the form of some rational parameter which measures the local structural ordering of water within the solvation shell. Moreover, the results of several independent investigations are reported: we adopt the harmonic approximation for an independent estimation of the water entropy within the solvation shell, and we also study structure of the water−water hydrogen bond network, mean geometry of a single hydrogen bond, the self-diffusion coefficients (both translational and rotational) of water, and the mean lifetimes of water−water and water−peptide hydrogen bonds. All the obtained results lead to the conclusion that the local structure of water within the solvation shell changes only slightly in comparison to the bulk one. If so, the measure of local water ordering proposed by us is exploited with the aim to gain the deeper insight on the structural properties of "solvation" water. It has been shown that this parameter can be factored into three terms, which measure translational, configurational, and orientational ordering, respectively. Using this factoring, the ordering map for a precise description of the water local ordering has been built. An interesting correlation is observed: the points on this map lie approximately on the straight line, while the linear conformations clearly deviate from the general tendency. Further analysis of the obtained results allows us to express the supposition that an increasing local ordering of water around given secondary structure corresponds to an increasing relative stability of this structure in aqueous solution. Analyzing the geometry of the water−water hydrogen bond network within the solvation layer, we find some systematic deviations of this geometry from the bulk water properties. We also observe that the alanine peptides (excluding the linear form) disturb the hydrogen bond network in the less range, and in another way than the various conformations of polyglycine, while the linear form of polyalanine behaves very similarly to the glycine ones. Next, investigating the dynamic properties, we also conclude that water near the peptide surface creates a pseudorigid structure, a "halo" around the peptide core. This "halo" is stabilized by slightly higher energy of the hydrogen bonds network: we have found that within this region the hydrogen bonds network is slightly less distorted, the water−water hydrogen bonds are a little more stable and their mean lifetime is clearly longer that that of bulk water. Significant differences between the alanine- and glycine-based polypeptides are also visible. It has also been found that this solvation layer interacts with the polyalanine in another way than with polyglycine. Although in the case of the glycine-based polypeptide this layer slides relatively freely over the peptide surface, for the alanine-based polypeptide this sliding is strongly hindered by the presence of the methyl groups, and this effect is additionally enhanced by a rise in the solvation layer rigidity. Thus, the survey of various dynamic properties allows us to perceive and to explain distinct differences in behavior of water within the solvation shell around both glycine and alanine peptides.


  • Structure and electric properties of double magnesium zirconium orthophosphate
    • Marta Wanarska
    • Sebastian Molin
    • Katarzyna Gdula-Kasica
    • Grzegorz Jasiński
    • Bogusław Kusz
    • Piotr Jasiński
    • Maria Gazda
    2010

    Publikacja przedstawia wyniki pomiarów elektrycznych i strukturalnych ortofosforanu magnezowo-cyrkonowego.


  • Structure and electrical properties of ceramic proton conductors obtained with molten-salt and solid-state synthesis methods
    • Marta Wanarska
    • Katarzyna Gdula-Kasica
    • Sebastian Molin
    • Piotr Jasiński
    • Bogusław Kusz
    • Maria Gazda
    2010 JOURNAL OF NON-CRYSTALLINE SOLIDS

    Publikacja omawia wyniki badań niobanu lantanu domieszkowanego akceptorowo pod kątem właściwości elektrycznych i strukturalnych.


  • Structure and superconductivity of VN-SiO2 films obtained by thermal nitridation of sol-gel derived coatings
    • Barbara Kościelska
    • Antoni Winiarski
    • Witold Jurga
    2010 JOURNAL OF NON-CRYSTALLINE SOLIDS

    Praca prezentuje wyniki badań strukturalnych oraz właściwości nadprzewodzących cienkich warstw xVN-(100-x)SiO2, gdzie x = 90, 80, 70, 60 mol%. Warstwy zostały wykonane metodą termicznego azotowania z użyciem amoniaku cienkich warstw tlenkowych otrzymanych metodą zol-żel. Badania struktury przeprowadzono metodami XRD oraz XPS, natomiast właściwości nadprzewodzące badano metodą MMMA. Właściwości nadprzewodzące warstw zależą zarówno od stosynku molowego VN/SiO2 jak również od grubości warstw. Nadprzewodnictwa nie zaobserwowano dla składu x = 90, co może być związane ze zbyt małą zawartością SiO2.


  • Structure modification of acridine antitumor agents results in changes of enzymatic activity and gene expression of CYP3A4 isoenzyme in HepG2 cells.
    • Magdalena Niemira
    • Anna Brillowska-Dąbrowska
    • Zofia Mazerska
    2010

    Ekspresja izoenzymu CYP3A4, który zaangażowany jest w metabolizm ok. 60% leków stosowanych klinicznie, może być modulowana przez takie czynniki jak: polimorfizm, czynniki transkrypcyjne oraz obecność ksenobiotyków. Przykładem induktorów genów kodujących izoenzym CYP3A4 jest fenobarbital i rifampicyna, których obecność w organizmie przyspiesza metabolizm innych leków stosowanych jednocześnie, które są substratami dla CYP3A4. Dlatego też, badania wpływu stosowanych leków na aktywność enzymatyczną oraz ekspresję genów kodujących białka metabolizujące ksenobiotyki jest niezwykle istotne w przewidywaniu skuteczności stosowanej terapii. Otrzymane dotychczas wyniki przemian metabolicznych badanych związków w komórkach HepG2 oraz poznanie ich wpływu na poziom białka CYP3A4 pozwoliły postawić hipotezę, iż różnych charakter przemian metabolicznych związany jest ze zróżnicowaną modulacją poziomu i aktywności białka enzymatycznego CYP3A4. W świetle otrzymanych wyników, przeprowadzono badanie wpływu obu pochodnych akrydyny na aktywność enzymatyczną i ekspresję izoenzymu CYP3A4 w komórkach HepG2. Wykazano, że oba związki obniżają aktywność enzymatyczną CYP3A4, jak również jego ekspresję. Jednakże pochodna metabolizująca do większej liczby aktywnych metabolitów, C-857, okazała się silniejszym inhibitorem od pochodnej C-1748. Podsumowując, przedstawione wyniki badań wskazują na istotny wpływ pochodnych C-857 i C-1748 na aktywność enzymatyczną i ekspresję izoenzymu CYP3A4 w komórkach HepG2, przy czym wpływ ten jest wyraźniejszy w przypadku zastosowania pochodnej bardziej reaktywnej, C-857.


  • Structures for parameterization, meshing and data exchange of topologically related surfaces of a ship hull
    • Aleksander Kniat
    2010

    This paper presents proposal of data structures for storage and processing of a parametric three-dimensional model of a midship hull sections. The model consists of coarse surfaces like: decks, frames, girders, stiffeners, brackets, partitions etc. bounded by topological relations. All workshop details are omitted as the model is intended for numeric calculations. Proposed data structures are prepared to facilitate changes in the model dimensions and automatic mesh generation. It is assumed to keep the model consistent and assure certain mesh parameters. The aim is to enable as quick as possible method of a midship hull model generation instead of time consuming modeling in a CAD program. Such approach enables quick prototyping and supports decisions during the design process. It also facilitates data exchange and serves for standardization. Parameterization of a frame cross-section and a transverse bulkhead of a typical bulk carrier are presented as examples and resulting three-dimensional meshed models are depicted.


  • Struktura miasta a zasady rozwoju zrównoważonego - wybrane problemy
    • Jacek Sołtys
    2010 Pełny tekst Czasopismo Techniczne

    Autor rozważa, co wynika dla struktur miejskich z zasad rozwoju zrównoważonego. Analizuje też dwa problemy: (1) zwartość miasta i koncentracja zabudowy a jego struktura przyrodnicza i dostęp mieszkańców do terenów zielonych; (2) system ośrodków usługowych jako narzędzie oszczędności czasu i energii a tendencje rozwoju struktur sieciowych.


  • Struktura triacylogliceroli olejów z nasion truskawki, maliny i czarnej porzeczki
    • Dorota Martysiak-Żurowska
    • Łukasz Drapała
    2010 Pełny tekst TŁUSZCZE JADALNE

    Przedmiotem badań było określenie struktury triacylogliceroli (TAG) olejów z nasion maliny, truskawki i czarnej porzeczki. W TAG badanych olejów pozycje zewnętrzne sn-1 i sn-3 zajmują głównie kwasy nasycone palmitynowy C16:0 i stearynowy C18:0 oraz kwas C18:1 (n-7). Przeważająca ilość kwasu linolowego C18:2 (n-6)występującego w badanych olejach zajmuje pozycje wewnętrzną sn-2. Udział procentowy pozostałych KT w pozycjach sn-1,3 i sn-2 badanych olejów jest bardziej zróżnicowany. Olej z nasion malin cechuje praktycznie statystyczne rozmieszczenie kwasu oleinowego między pozycje sn-2 i sn-1,3 TAG i przewaga udziału procentowego kwasu alfa-linolenowego ALA w pozycjach zewnętrznych (72,8%). Natomiast w oleju z nasion truskawki kwas oleinowy preferuje pozycję sn-2 TAG (38,2%). W TAG tego oleju ALA również wykazuje tendencję obsadzania pozycji sn-1,3 (ok.71%). W oleju z nasion czarnej porzeczki kwas oleinowy okupuje głównie pozycje wewnętrzną sn-2 (47,5%), natomiast ALA dominuje w pozycjach sn-1,3 (ok.84%). Występujący w oleju z nasion czarnej porzeczki kwas gamma-linolenowy GLA wykazuje tendencje obsadzania pozycji wewnętrznej TAG (37,4%), natomiast kwas stearidonowy STA preferuje pozycje zewnętrzne TAG (72,3%).


  • Student model representation for pedagogical virtual mentors
    • Agnieszka Landowska
    2010 Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne

    The paper concerns technological aspects of virtual mentors construction, especially concentrating on the student model representation. The article distinguishes several types of information that is gathered by the pedagogical agents and other educational platforms, including student knowledge model, student progress tracking, interaction process patterns and learner preferences. A set of technologies used for the student model representation is also mentioned. In the paper a three-level student model framework that can be applied in educational agents is proposed. The model is intended to manage complexity of a student model for adaptive, intelligent and affective agents. The article provides an example of the model application in GERDA educational agent that is developed in the research project held by the author. The student model representation may be applied in virtual mentors as well as other e-learning software, especially in Intelligent Tutoring Systems.


  • Studies of Nonlinear Sound Dynamics in Fluids Based on the Caloric Equation of State
    • Anna Perelomova
    • Paweł Wojda
    2010 Pełny tekst Archives of Acoustics

    The sound speed and parameters of nonlinearity B/A, C/A in a fluid are expressed in terms of coefficients in the Taylor series expansion of an excess internal energy, in powers of excess pressure and density. That allows to conclude about features of the sound propagation in fluids, the internal energy of which is known as a function of pressure and density. The sound speed and parameters of nonlinearity in the mixture consisting of boiling water and its vapor under different temperatures, are evaluated as functions of mass concentration of the vapor. The relations analogous to that in the Riemann wave in an ideal gas are obtained in a fluid obeying an arbitrary equation of state. An example concerns the van der Waals gases. An excess pressure in the reflected wave, which appears when standard or nonlinear absorption in a fluid takes place, is evaluated in an arbitrary fluid.


  • Studies on development of headspace - gas chromatographic determination of volatile fatty acids in troublesome environmental samples
    • Bogdan Zygmunt
    • Anna Banel
    • Marta Wasielewska
    • Monika Felchner - Żwirełło
    2010

    Badania nad opracowaniem procedur oznaczania LKT w silnie zanieczyszczonych próbkach środowiskowych za pomocą techniki analizy fazy nadpowierzchniowej w połączeniu z chromatografią gazową z wykorzystaniem detektora płomieniowo-jonizacyjnego na etapie oznaczeń końcowych. Dobrano warunki ekstrakcji LKT do fazy nadpowierzchniowej oraz warunki chromatograficzne. Metodyka pozwala oznaczać LKT w bardzo skomplikowanych próbkach ciekłych zawierających materię zawieszoną, wysokocząsteczkowe związki organiczne etc. Metodykę wykorzystano do analizy odcieków z pryzm odpadów organicznych w ogrodzie zoologicznym i ścieków z farm hodowli bydła.


  • Studies on the influence of technological variants of finishing machining on flow of parts in flexible manufacturing
    • Włodzimierz Przybylski
    • Bogdan Ścibiorski
    2010 Pełny tekst Advances in Manufacturing Science and Technology

    In the article below the problems of influence of variants of finishing processing on flow of machining parts in flexible manufacturing system were presented. The investigations were carried out the technological processes for piston rods and rams of hydraulic cylinders. There were also presented model variants of technological processes for piston rods finished with the burnishing. In these studies the influence of technological variants including burnishing and grinding process on production scheduling was carefully analyzed. Basing on the idea of preliminary scheduling method the attempt of estimation how the technological variants influence the productions of flexible manufacturing system was made. W prezentowanym artykule przedstawiono problematykę wpływu wariantów obróbki wykończeniowej na przepływ części obrabianych w elastycznym systemie produkcyjnym. Badania przeprowadzono dla wariantów procesów technologicznych tłoczysk i nurników siłowników hydraulicznych. Ponadto zamieszczono przykładowe warianty procesów technologicznych dla tłoczysk z uwzględnieniem obróbki wykańczającej przez nagniatanie. Szczególnie przeanalizowano wpływ wariantów technologicznych z uwzględnieniem obróbki przez szlifowanie i nagniatanie na harmonogram produkcji. W przeprowadzonych badaniach podjęto próbę oceny wpływu wariantów technologicznych na efektywność wytwarzania elastycznego systemu produkcyjnego na podstawie harmonogramów wstępnych produkcji.


  • Study of structures and properties of the laser cladding exhaust valve after service
    • Włodzimierz Kończewicz
    • Przemysław Krużycki
    • Hanna Smoleńska
    2010 Pełny tekst Journal of KONES

    Przylgnie zaworów wydechowych silnie obciążonego silnika okrętowego zostały pokryte warstwą wykonana ze stopu kobaltu za pomocą techniki napawania laserowego. Tak przygotowane zawory były eksploatowane przez 3000 godzin w silniku Daru Młodzieży. Po tym czasie zostały zdemontowane i poddane szczegółowej analizie. Warunki pracy spowodowały powstanie na powierzchni przylgni warstwy tlenków o różnej grubości, wykazującej skłonność do pękania i odwarstwiania się. Analiza mikrostruktury na przekroju nie wykazała znaczącej degradacji.Zaobserwowano spadek twardości warstwy ale nadal wyższa niż podłoża stalowego. Ten typ napoin może być zalecany do zastosowania w celu przedłużenia żywotności zaworów.


  • Style zarządzania pracownikami
    • Małgorzata Rozkwitalska
    2010

    W artykule omówiono style zarządzania pracownikami oraz warunki ich stosowania.


  • Substancje o działaniu przeciwdrobnoustrojowym jako składniki biodegradowalnych folii z polimerów naturalnych
    • Edyta Malinowska-Pańczyk
    • Katarzyna Sztuka
    • Ilona Kołodziejska
    2010 Pełny tekst Polimery

    Artykuł stanowi przegląd literatury dotyczący substancji dodawanych do folii wytworzonych z biodegradowalnych polimerów naturalnych, przeznaczonych do pakowania żywności, w celu nadania im właściwości przeciwdrobnoustrojowych. Omówiono czynniki przeciwdrobnoustrojowe będące składnikami folii z naturalnych polimerów, takie jak: kwasy organiczne, enzymy i bakteriocyny a także, dodawane do opakowań otrzymywanych z polimerów syntetycznych, biobójcze srebro w postaci nanocząstek lub koloidu. Scharakteryzowano też, wykazujący działanie przeciwdrobnoustrojowe, naturalny polisacharyd chitozan wykorzystywany do produkcji opakowań do żywności.


  • Sudden death of effective entanglement
    • Krzysztof Roszak
    • Michał Horodecki
    • Paweł Horodecki
    2010 Pełny tekst PHYSICAL REVIEW A

    Sudden death of entanglement is a well-known effect resulting from the finite volume of separable states. We study the case when the observer has a limited measurement capability and analyze the effective entanglement (i.e., entanglement minimized over the output data). We show that in the well-defined system of two quantum dots monitored by single-electron transistors, one may observe a sudden death of effective entanglement when real, physical entanglement is still alive. For certain measurement setups, this occurs even for initial states for which sudden death of physical entanglement is not possible at all. The principles of the analysis may be applied to other analogous scenarios, such as estimation of the parameters arising from quantum process tomography.


  • Superconducting properties of NbN-SiO2 sol-gel derived thin films
    • Barbara Kościelska
    • Olga Yuzephovich
    • Siergiej Bengus
    • Agnieszka Witkowska
    2010 Pełny tekst ACTA PHYSICA POLONICA A

    Praca przedstawia wyniki badań właściwości nadprzewodzących cienkich warstw xNbN-(100-x)SiO2, gdzie x = 80 mol%, o różnych grubościach (od 450 do 1950 nm. Badania przeprowadzono w oparciu o pomiary przewodnictwa elektrycznego w polu i bez pola magnetycznego. Właściwości nadprzewodzące warstw zależą od ich grubości. Przejście nadprzewodzące warstw jest szerokie, co związane jest z aktywowanym termicznie pełzaniem strumienia pola magnetycznego. Temperatury krytyczne są nieco niższe od literaturowych, co może być spowodowane odchyleniem od stechiometrii NbN


  • Superconductivity of 80NbN-20SiO2 granular films
    • O.i. Yuzephovich
    • S.v. Bengus
    • Barbara Kościelska
    • Agnieszka Witkowska
    2010 LOW TEMPERATURE PHYSICS

    Praca przedstawia badania właściwości nadprzewodzących warstw 80%NbN-20%SiO2 (procent molowy) o różnej grubości otrzymanych metodą zol-żel. Przejście nadprzewodzące badanych warstw mierzone w polu magnetycznym jest szerokie, co wyjaśnione zostało termicznie aktywowanym płynięciem pola magnetycznego wnikającego do próbki. W wysokich polach zaobserwowano w badanych warstwach indukowane polem magnetycznym przejście nadprzewodnik - izolator.


  • Superkondensatory elektrochemiczne jako urządzenia do magazynowania energii
    • Anna Lisowska-Oleksiak
    • Andrzej Nowak
    • Monika Wilamowska-Zawłocka
    2010 Pełny tekst Acta Energetica

    W artykule przedstawiono zasady działania superkondensatorów ich charakterystykę pracy oraz przykłady zastosowania w praktyce.